牡蛎是滤食性贝类。近江牡蛎在自然海区平均每天摄食16 -19h，其余时间为无规律的间歇性摄食，而且其摄食率无明显的昼夜变化。

牡蛎摄食有明显的季节性。以日本广岛湾养殖的太平洋牡蛎为例，6月份牡蛎个体较小，摄食量很少；7月份以后水温不断升高，牡蛎生长加快，摄食量不断增加，10 - 11月份达到摄食高峰；11月份以后，由于水温下降摄食量也逐渐减少，冬季摄食量保持在一定水平。近江牡蛎在水温10 - 25℃时摄食旺盛，而在繁殖季节摄食较弱。

此外，海洋浮游植物所含叶绿素的量与牡蛎摄食及生长有一定的关系。研究表明，在每立方米海水中含有2mg叶绿素的情况下，太平洋牡蛎的软体部重量每月能增加约l.2g;在含有6mg叶绿素的海区，每月能增加约2g。

水温和盐度的变化对牡蛎的摄食活动有一定的影响。由于牡蛎营固着生活，开壳滤水直接关系到其摄食活动。牡蛎在早晨水温最低时，呈闭壳状态；下午水温最高时，开壳频率高，开壳的幅度也最大。一般牡蛎的滤水量为每小时5-25L，短时间内可达30L。当海水的盐度低到一定程度时，牡蛎就会紧闭双壳，停止摄食，以防低盐度海水的侵入。但若低盐度持续时间过长，牡蛎不得不开壳进行呼吸和摄食时，就会固体内渗透压的改变而引起死亡。

海水的混浊度对牡蛎的摄食也有一定影响。一般地说，比较澄清的海水便于牡蛎的摄食，但此时海水中的浮游生物量较少，比较混浊的海水含浮游生物等食料较多，对摄食有利，但悬浮物过多时，就会有许多牡蛎不能摄食的悬浮物质进入外套腔或粘在鳃的表面而对摄食产生不良影响。