海南沼虾在不同的生长发育阶段生活习性也有所不同。它虽属于淡水虾类，但在其早期阶段，必须在河口成淡水中度过。幼体自卵孵出后，在河口成淡水中发育变态。在这期间，营浮游生活，腹部朝上，尾部倾斜向上，整个身体倒置后行浮动或进行弹跳运动。幼体的前期有较强的趋光性，喜集群活动。完成变态后，转营底栖生活，并开始集群上溯到江河的淡水中生活。

在上溯期间，昼伏夜行。遇食物丰富、宜于隐蔽柄息的场所时，便逐渐停留下来，开始单独活动。白天匍匐爬行或隐蔽于江河两岸的石缝、深水处的乱石堆及水草丛中，活动较少。到了傍晚，便开始到浅水处觅食，活动十分频繁。蜕壳、产卵等也多在夜间进行。海南沼虾活动时，通常为匍匐爬行，但也可在水中缓慢游动，遇敌或受惊时则迅速后退躲入附近草丛、石缝等隐蔽物中，或强力弹跳，急速躲避。

海南沼虾有占地盘的习性．通常一只虾找到一个较好的隐蔽处后，就拒绝其他的虾靠近。若遇到其他虾入侵时，则奋起第：一步足舞动威胁。如入侵的虾较为强壮，则逃避而另找栖息地罔此，一般强壮的虾所占地盘较好。