大蒜锈病主要侵染叶片和假茎。发病初期为梭形褪绿斑，其后在表皮下现出圆形或椭圆形稍凸起的泡斑，表皮破裂后散出橙黄色粉状物，病斑四周常有黄色的圈，危害严重时病斑连片致全叶黄枯，植株也提前枯死。生长后期，未破裂的病斑变成黑色。病菌除侵染大蒜外，还可危害葱、洋葱、韭菜等。

为了减轻大蒜锈病的危害，如紫皮蒜，小石口大蒜、舒城蒜等品种较耐病，可因地制宜选用。避免葱蒜混种，注意清洁田园以减少初侵染源。适时晚播，合理施肥，减少灌水次数，杜绝大水漫灌。遇有降雨多的年份，早春要及时检查发病中心，喷药预防。发病初期，选用15%三唑酮可湿性粉剂l500倍液，或20%三唑酮乳油2000倍液、97%敌锈钠可湿性粉剂300倍液、25%敌力脱乳油3000倍液，或25%敌力脱乳油4000倍液加15%三唑酮可湿性粉剂2000倍液、70%代森锰锌可湿性粉剂1000倍液加15%三唑酮可湿性粉剂2000倍液，隔10-15天用药1次，防治2-3次。