小麦纹枯病主要采用化学防治与农业措施相结合的综合防治方法，播种时要选择抗病性较好的品种，不可将单一抗原品种进行大面积种植，播种前可用咯菌腈悬浮剂、戊唑醇悬浮拌种剂、粉锈宁可湿性粉剂等药剂进行拌种，生长过程合理施用氮肥、磷肥、钾肥，提高小麦抗病能力，进入拔节期后可适量使用苯甲·丙环唑乳油。
1、防治小麦纹枯病，要采用化学防治与农业措施相结合的综合防治方法，这样才能有效地预防小麦纹枯病。
2、可根据当地的气候环境，种植抗病性较好的品种，同时也要规划好小麦品种的合理布局，不可将单一抗原品种进行大面积种植。
3、种植过程中，要增施有机肥，采用配方施肥，可合理施用氮肥、磷肥、钾肥，不可只施或者过度施用氮肥，合理施肥可以控制小麦旺长，并促进小麦根系健壮生长，从而提高小麦的抗病能力。
4、期间要在适宜的时间进行播种，避免早播，可采用小麦精量播种技术，使其降低小麦播种量。
5、小麦在返青后，要早浇或者轻浇返青水，不可进行大水漫灌，以防造成植株间长期湿度过大，生长期间要及时清除田间杂草，雨水季节要在雨后及时排水，有利于控制病虫害的发生。
6、在播种小麦之前，要使用药剂拌种，期间可用2.5%咯菌腈悬浮剂100-200ml/100kg种子，或者0.8%腈·戊悬浮种衣剂药种比为1:40-50，或者种子重量0.03%的15%粉锈宁可湿性粉剂进行拌种，或者5%戊唑醇悬浮拌种剂每200斤种子拌种70-80g。
7、在春季小麦进入拔节期，每亩可用30%苯甲·丙环唑10g，或者5%井冈霉素40g，或者12.5%烯唑醇可湿性粉剂15g，或者10%苯醚甲环唑水分散粒剂20g，防治效果要比单独拌种增高20%-30%。
8、期间使用30%苯甲·丙环唑乳油，不仅防治小麦纹枯病效果较好，还有很好的抗倒和提高产量的作用，增产幅度为2%-10%左右，如果小麦纹枯病比较严重，可隔10-15天再喷1次药。