叶片：凤丹叶子无分叉，牡丹叶子会分三叉。根系：凤丹根系不发达，牡丹根系发达有须根。枝条：凤丹枝条笔直枝条少，芽间距长；牡丹弯曲枝条多，芽间距短。花朵：凤丹白色单瓣花朵，牡丹花朵大颜色多。结种：凤丹结种，牡丹只开花不结种。

一、叶片

等叶子展开后观察，凤丹的叶子没有分叉；牡丹的叶子基本会分三叉。

二、根系

凤丹的根系肉质根十分明显，且根系不发达；牡丹的根系比较发达，会很有很多须根。根系比较多的就是牡丹。

三、枝条

凤丹的枝条比较少，长的也比较笔直，且每个芽之间的距离比较长，等到秋季时杆径会变的比较空，还很容易脱皮；牡丹的枝条有很多，长的不是很笔直，有微微弯曲的现象，芽间距很短，枝条不容易脱皮且比较光滑。

四、花朵

凤丹是白色的单瓣花朵；牡丹花朵长的很大，因品种不同花朵的颜色也不同，比如白色、粉色、黄色等。

五、结种

凤丹会结种子，也就是会开花结果；牡丹一般不会结种子，花开的越好越不结种子，也就是说只开花不结果。