芦荟的病害有锈病、褐斑病以及叶枯病。锈病是芦荟最常发生的病症之一，若发生病害，及时清除芦荟病残叶，并将其烧毁。在芦荟褐斑病的发病初期，叶片上会出现许多墨绿色的水渍状病斑，发现病叶，立即将其摘除并销毁。叶枯病可用药物防治。
锈病
锈病是芦荟最常发生的病症之一，多在夏季气温高，湿度大的时候发生。病源通过孢子传播随病株残留在土壤的表面进行越冬。孢子堆生在表皮下，破裂后呈黑褐色。
需要精心养护，注意观察，若发生病害，及时清除芦荟病残叶，并将其烧毁。
褐斑病
在芦荟褐斑病的发病初期，叶片上会出现许多墨绿色的水渍状病斑，并随着病症的不断加重，病斑逐渐扩大变成圆形。发病后期，病斑会出现许多黑色的颗粒物。病害越中，颗粒物越多，严重者会导致整盆芦荟的腐烂。
1、要栽植抗病的品种。
2、加强对盆栽的管理与呵护，注意室温适宜，保持通风，施肥均衡。
3、多注意观察盆栽，一有发现病叶，立即将其摘除并销毁。
4、发生病害是，可以喷洒百菌清75%粉剂1000倍药液。2-3周喷洒1次,1年内喷洒3-4次即可。
叶枯病
叶枯病多发生在南方地区，通过水或者昆虫进行传播，其发病症状有叶尖处产生黑褐色的小斑点，后逐渐扩展，干枯，病斑皱缩，后期产生排列状的小黑点。
1、注意观察，防治病害的传播
2、种植多选用抗病能力强的品种，如中国芦荟，库拉索等。
3、芦荟不耐寒，因此要注意肥水的配合，增强它的抗病能力。
4、盆栽药剂进行防治（75%百菌清可湿性粉剂600倍药液）。